启因生物-应用qPCR探索微生物世界

Distribution pattern of antibiotic resistance genes and bacterial community in agricultural soil samples of Wuliangsuhai watershed. China

WeiShi，YongLiu，JunjianLi，HongZhang，RuiShi，JianwenChen，HongjianLi

期刊：Agriculture, Ecosystems & Environment

IF:5.567

发表时间：2020年6月

作者单位：山西大学 黄土高原研究所

亮点

•城市核心区附近土壤中细菌和ARG的丰度较高。

•intI1（MGEs）的丰度与sulI，sulII呈正相关。

•污染导致细菌群落丰度高，多样性低。

•Firmicutes和Proteobacteria是潜在的ARGs宿主细菌群落。

文章摘要

抗生素抗性基因（ARGs）的发生和传播是世界范围内的主要问题，对公众健康构成重大威胁。目前的研究集中在中国武陵苏海流域农业土壤中。在土壤样品中共鉴定出33种ARG，属于8种主要类型，其中mexF，blaTEM，vanD，sulI，sulII和oprJ是主要的ARG。ARG的丰度范围为2.18 × 10−6–1.9 × 10-2拷贝/16S rRNA基因拷贝。相关分析结果证实，intI1与ARGs（aadA1，aadA2，mphA，sulI和sulII）显着相关，表明这些基因在土壤中具有潜在的水平转移能力。基于不同采样点与城市地区的接近程度，我们发现城市近端地区细菌群落和ARGs丰度显着增加，表明农业活动和工业污染可能改变细菌群落结构和空间分布ARGs。此外，ARGs与环境因子之间的相关性证实了微生物群落分布与土壤有机质（SOM），有效磷（AP）和全氮（TN）等环境因素的关系。ARGs和细菌类群的共生模式表明厚壁菌门和变形菌门的演替可能是所检测的不同采样点ARGs变异的潜在驱动因素。这些发现有望提高目前对ARG分布及其与微生物群落演替关系的认识。

原文链接：https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0167880920300694