启因生物-应用qPCR探索微生物世界

Responses and successions of sulfonamides, tetracyclines and fluoroquinolones resistance genes and bacterial community during the short-term storage of biogas residue and organic manure under the incubator and natural conditions

Chengjun Pu, Liquan Liu, Meng Yao, Hang Liu, Ying Sun

期刊：Environmental Pollution

IF:8.071

发表时间：2018年11月

作者单位：中国农业大学资源与环境科学学院农田土壤污染防治北京重点实验室，北京

亮点

•在BR中发现了sul，tet和qnr的富集，但在OM中变化范围很窄。

•自然条件下BR中ARB和ARG的增殖受到各种环境因素的影响。

•BR储存期间细菌群落发生显着变化，但在OM储存期间略有变化。

•沼气残渣复杂的网络关系推动了ARB和ARG的大量演替。

文章摘要

沼气残留物和有机肥经常用于作物种植。然而，抗生素抗性细菌（ARB），抗生素抗性基因（ARG）和细菌群落在应用于田间之前的评估仍然缺乏。本研究通过活板计数监测了沼气残留物和有机肥28天有氧储存期间对磺胺嘧啶，四环素和诺氟沙星，磺胺类，四环素类和氟喹诺酮类以及细菌群落的57种抗性基因的抗性变化，高通量qPCR和Illumina MiSeq测序方法。然后是两个储存条件，培养箱（25 °C）和自然环境，用于评估ARB和ARG对环境因素的响应。结果表明，沼气残渣和有机肥中共检测到35种和21种ARG。在储存28天后，ARB和ARG在沼气残留物中富集高达8.01倍，但在有机肥储存期间变化范围很窄。与培养箱条件相比，自然条件下沼气渣中ARB和ARGs的增殖受到各种复杂环境因素的相对抑制。然而，我们发现培养箱和自然条件下有机肥中ARB和ARG没有显着差异。在沼气残留物储存过程中，细菌群落也发生了变化，特别是拟杆菌VC2。1_Bac22，水母发光蛋白，Luteimonas和Arenimonas。网络分析表明，沼气残留物的关系比有机肥复杂得多，最终导致沼气残留物短期储存过程中ARB和ARG的大量演替。因此，我们建议在将沼气残留物应用于田间之前应采取进一步措施。

原文链接：https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0269749118324783